如果能够在RNA合成过程中，对刚刚产生的新生RNA进行特异性标记，就可以将“正在发生的转录活动”与细胞中已经存在的RNA区分开来。

这正是新生RNA代谢标记技术（Nascent RNA Labeling）的核心思路。

通过向细胞提供经过化学修饰的核苷三磷酸，使其在RNA转录过程中被掺入新合成的RNA链，再利用特异性的化学反应进行检测或富集，研究人员便能够进一步追踪RNA的产生、变化及动态过程。

其中，5-Ethynyl-UTP（5-乙炔基尿苷5ʹ-(四氢三磷酸)）是一种重要的化学修饰核苷三磷酸，可用于新生RNA的标记，并为后续检测、富集及测序分析提供化学基础。

中文名：5-乙炔基尿苷 5ʹ-(四氢三磷酸)

英文名：5-Ethynyluridine 5ʹ-(tetrahydrogen triphosphate)

简  称：5-Ethynyl-UTP

CAS号：1004955-96-7

分子式：C11H15N2O15P3

分子量：508.16

规  格：25 ul / 100 ul / 1 ml（支持定制包装）

形  态：水溶液

货  号：G09010023

库  存：现货

浓  度：~100 mM in water

5-Ethynyl-UTP是一种可直接掺入RNA分子的化学修饰核苷三磷酸，是实现新生RNA标记、检测与富集的核心原料。

为了突破这一瓶颈，新生RNA代谢标记技术应运而生。而实现这一技术的关键，正是一款高效的化学修饰核苷酸——5-Ethynyl-UTP。

它的工作原理非常精妙且高效：

1. 精准掺入：在体外转录体系或通透性细胞系统中，RNA聚合酶将5-Ethynyl-UTP识别为普通的 UTP，并直接掺入到新合成的RNA链中。因此，在标记窗口内合成并掺入该核苷类似物的RNA可获得相应的化学标记。

2. 点击化学反应：利用5-Ethynyl-UTP末端的炔基（-C≡CH）这一微小的“把手”，通过点击化学反应，可利用炔基与叠氮基之间的生物正交反应进行后续标记。

3. 定向追踪：通过这种稳定的共价连接，通过共价连接将相应报告基团引入已标记的新生RNA，从而实现后续检测或富集。

标记后，我们能做什么？5-Ethynyl-UTP不仅仅是一个化学标记，更是打开RNA生命动态窗口的钥匙。在实际科研中，它能帮您完成以下核心工作：

1. 检测RNA合成速率与转录动力学

动态监测细胞在特定生理、病理或微环境刺激（如小分子干预、环境应激、细胞分化等）下，转录水平的瞬时波动。

2. 解析转录调控机制与小分子抑制剂效应

在转录调控及药物筛选研究中，5-Ethynyl-UTP 是定量评估候选化合物对转录系统干预效应的灵敏指标。

3. 新生RNA的特异性富集与高通量测序（EU-seq）

利用点击化学将生物素-叠氮偶联至新生RNA，再经链霉亲和素磁珠亲和纯化，可实现新生RNA的特异性富集与高通量测序分析，用于非编码RNA和前体mRNA加工与降解动力学研究。

与传统的放射性同位素标记（如³²P-UTP）或较旧的抗体检测法（如Br-UTP）相比，5-Ethynyl-UTP展现出明显的技术优势：

✅ 灵敏与低噪：点击化学反应效率高，信号清晰，背景低，可用于低丰度新生RNA的标记及后续检测。

✅ 生物正交特异性：炔基与叠氮基具有良好的生物正交性，有利于降低非特异性反应对标记结果的影响。

✅ RNA完整性保护：反应条件温和，对RNA结构损伤小，可与后续测序、qRT-PCR等分析流程衔接，为新生RNA研究提供标记基础。

✅ 无需放射性标记：无需使用³²P等放射性核素，可减少放射性实验相关的操作与管理要求。